Итак, с помощью команды rm по SSH можно удалить каталог и все подкаталоги, а также файлы, находящиеся в нем.

Дополнительно используем ключи -r и -f, которые и задают рекурсивное стирание, а также отсутствие запрашиваемых консолью подтверждений со стороны пользователя.

Пример:

rm -r -f "www/bitrix"